Algorithmische Bioinformatik

Organisationseinheit
Freie Universität Berlin/Fachbereich Mathematik und Informatik/Institut für Informatik

Bereich

Zugangsvoraussetzungen

Keine

Qualifikationsziele

Die Studentinnen und Studenten besitzen grundlegende Kenntnisse und ein Verständnis der Algorithmen der modernen Bioinformatik in Theorie und Praxis.

Inhalte

Fortgeschrittene Algorithmen für paarweises und multiples Alignment
Praktische Datenbanksuchalgorithmen und Filterverfahren
Statistische Signifikanz von Sequenzähnlichkeit und Ergebnissen von Datenbanksuchen
Statistische Signalanalyse mittels (hidden) Markov Models, Anwendungen in Mustersuche und Genvorhersage
Algorithmen zur Rekonstruktion phylogenetischer Bäume
Algorithmen zur Kartierung und Sequenzierung von Genomen
Algorithmen zur RNA-Strukturvorhersage und RNA-Vergleich
Modelle und Algorithmen zur Proteinstruktur-Analyse
Auswertung von Daten aus aktuellen Technologien der funktionellen Genomik

Lehr- und Lernformen

Aktive Teilnahme

Vorlesung
4 SWS
Teilnahme empfohlen

Diskussionsteilnahme Schriftliche Bearbeitung von Übungsaufgaben Erfolgreiche Implementierung von Programmieraufgaben; Abschlussvortrag zum Praktikum

Übung
2 SWS
verpflichtete Teilnahme

Diskussionsteilnahme Schriftliche Bearbeitung von Übungsaufgaben Erfolgreiche Implementierung von Programmieraufgaben; Abschlussvortrag zum Praktikum

Praktikum
2 SWS
verpflichtete Teilnahme

Diskussionsteilnahme Schriftliche Bearbeitung von Übungsaufgaben Erfolgreiche Implementierung von Programmieraufgaben; Abschlussvortrag zum Praktikum

Aufwand

Präsenzzeit Vorlesung	60 Stunden
Vor- und Nachbereitung Vorlesung	80 Stunden
Präsenzzeit Übung	30 Stunden
Vor- und Nachbereitung Übung	80 Stunden
Präsenzzeit Praktikum	30 Stunden
Vor- und Nachbereitung Praktikum	60 Stunden
Prüfungsvorbereitung und Prüfung	80 Stunden

Modulprüfung
Klausur (90 Minuten)

Differenzierte Bewertung
differenzierte Bewertung

Modulsprache
Deutsch

Arbeitsaufwand (Stunden)
420

Leistungspunkte (LP)
14

Dauer des Moduls
Ein Semester

Häufigkeit des Angebots
Jedes Wintersemester

Verwendbarkeit

Bachelorstudiengang Bioinformatik