Computer-Aided Drug Design

Organisationseinheit
Fakultät der Charité – Universitätsmedizin Berlin

Bereich

Profilstudium mit der Ausrichtung Complex Systems
Praxismodul

Zugangsvoraussetzungen

Keine

Qualifikationsziele

Die Studierenden kennen und verstehen verschiedene Methoden der Chemieinformatik und strukturellen Bioinformatik für den Computergestützten Wirkstoffentwurf, inklusive verfügbarer Software und Datenquellen. Sie können diese Methoden praktisch anwenden (Programmieranteil) und an einem Fallbeispiel kritisch diskutieren und analysieren. Der Kurs soll die Studierenden dazu befähigen, ihre eigene Wirkstoffentwurf-Pipeline zu entwerfen und ihre Ergebnisse zu beurteilen.

Inhalte

Es werden vertieft Themen aus folgenden Gebieten behandelt:

Computer-gestützter Wirkstoffentwurf
Proteinstrukturen und Protein-Ligand Wechselwirkungen
Verfügbare Datenbanken für Protein und Molekülstrukturen, Datengenerierung und Analyse
Visualisierung von Molekülen und Wechselwirkungen
Ligand-basierte Methoden (Fokus auf kleine Moleküle): l Moleküldeskriptoren, Molekülvergleich, Substrukturen und Filtern l Virtuelles Screening, Maschinelles Lernen l ADMET Vorhersage
Struktur-basierte Methoden (Fokus auf Proteinstrukturen): l Homologie Modellierung l Protein-Ligand Docking l Aktive Zentren im Protein und deren Vergleich l Off-Target Vorhersage
Praktische Anwendung, inkl. Programmierung (in Python)

Lehr- und Lernformen

Aktive Teilnahme

Praxisseminar
4 SWS
verpflichtete Teilnahme

Bearbeitung der Aufgaben, Darstellung der Ergebnisse

Aufwand

Präsenzzeit	60 Stunden
Vor- und Nachbereitung	70 Stunden
Prüfungsvorbereitung und Prüfung	20 Stunden

Modulprüfung
Schriftliche Präsentation (ca. 5 Seiten) oder mündliche Präsentation (ca. 15 Minuten)

Differenzierte Bewertung
differenzierte Bewertung

Modulsprache
Englisch

Arbeitsaufwand (Stunden)
150

Leistungspunkte (LP)
5

Dauer des Moduls
Ein Semester

Häufigkeit des Angebots
Unregelmäßig

Verwendbarkeit

Masterstudiengang Bioinformatik