Structural Bioinformatics

Organisationseinheit
Fakultät der Charité – Universitätsmedizin Berlin

Bereich

Profilstudium mit der Ausrichtung Data Science

Zugangsvoraussetzungen

Keine

Qualifikationsziele

Die Studierenden kennen die aktuellen und forschungsnahen Algorithmen zur Analyse biologischer Strukturen. Sie sind in der Lage, Stärken und Schwächen verschiedener Herangehensweisen einzuschätzen und können selbstständig einordnen, bei welchem Analyseproblem welche Algorithmen adäquat sind.

Inhalte

Es werden vertieft Themen aus folgenden Gebieten behandelt:

Struktur, Funktion und Dynamik von Proteinen
Algorithmen zur molekularen Ähnlichkeit und ihre Anwendung
Methoden zur Berechnung (multipler) lokaler und globaler Struktur-Alignements
Docking von organischen Kleinstrukturen an Proteine sowie Protein-Protein-Docking

Lehr- und Lernformen

Aktive Teilnahme

Vorlesung
2 SWS
Teilnahme empfohlen

Nachbearbeitung der Inhalte der Vorlesung und selbstständiges Erarbeiten von ergänzender Literatur Bearbeitung der Übungsaufgaben Recherche, Präsentation und Diskussion

Übung
1 SWS
verpflichtete Teilnahme

Nachbearbeitung der Inhalte der Vorlesung und selbstständiges Erarbeiten von ergänzender Literatur Bearbeitung der Übungsaufgaben Recherche, Präsentation und Diskussion

Seminar
2 SWS
verpflichtete Teilnahme

Nachbearbeitung der Inhalte der Vorlesung und selbstständiges Erarbeiten von ergänzender Literatur Bearbeitung der Übungsaufgaben Recherche, Präsentation und Diskussion

Aufwand

Präsenzzeit V	30 Stunden
Vor- und Nachbereitung V	45 Stunden
Präsenzzeit Ü	15 Stunden
Vor- und Nachbereitung Ü	60 Stunden
Präsenzzeit S	30 Stunden
Vor- und Nachbereitung S	60 Stunden
Prüfungsvorbereitung und Prüfung	60 Stunden

Modulprüfung
Klausur (90 Minuten), die Klausur kann auch in Form einer elektronischen Prüfungsleistung durchgeführt werden, oder mündliche Prüfung (ca. 20 Minuten)

Differenzierte Bewertung
differenzierte Bewertung

Modulsprache
Englisch

Arbeitsaufwand (Stunden)
300

Leistungspunkte (LP)
10

Dauer des Moduls
Ein Semester

Häufigkeit des Angebots
Unregelmäßig

Verwendbarkeit

Masterstudiengang Bioinformatik